a，此处使用的构造的单个A260紫外线熔融曲线 。miR-34a – MSIRT1双链体 ，miR-34a – MSIRT1将ES双链体 ，miR-34a – complentary-strand双链链和miR-34a单链RNA（SSRNA）测量为三种技术独立复制（以不同的颜色显示为不同的颜色； n = 1） 。绘制了个人技术重复。TM值显示为平均值±S.D.单个技术重复中拟合的TM值（n = 3） 。测量并绘制了其他SSRNA（底行）作为单个技术重复；拟合的TM值以95％（n = 1）的相关置信区间显示为实验误差的估计值 。根据系统的分子性，绘制了归一化的差异融化曲线（ΔA260/ΔT）作为温度（k）（圆圈）的函数（在k）（圆圈）的函数（在k）（圆圈）（圆圈）的函数（圆圈）（圆圈）（圆圈）（1a）或（1b）（曲线）。B ，miR-34a-MSIRT1双链体的EMSA滴定曲线 ，miR-34a – msirt1捕获的ES双链体和miR-34a – complentary-strand双工，以三种独立的技术重复测量 。将结合与总miR-34a 3'-Cy3的比率绘制为滴定浓度（圆圈）的函数 ，并拟合标准结合等温线（线）（补充方程（2）） 。情节中心是均值；错误条代表1 S.D.从三个独立的重复。拟合的KD值以及95％的置信区间显示为实验误差的估计（n = 3） 。通过检测Cy3荧光获取凝胶图像 。在滴定期间 ，miR-34a 3'-Cy3保持在24 nm的恒定浓度，为估计KD的灵敏度限制（补充图1A – C）。MSIRT1及其捕获的E对应物在其形成具有miR-34a的稳定RNA-RNA双链体的能力上等效。与MSIRT1（124.3±21.7 nm）和Trapped-ES MSIRT1（110.3±23.0 nm）相比 ，互补链（48.4±9.5 nm）观察到更紧密的结合 ，为KD估计的动态范围提供了控制 。c， MSIRT1的平衡FBA轮廓，MSIRT1被困ES和炒作控制 ，与MiR-34a负载的AGO2结合 。将三个目标分别测量为三个独立重复 ，并拟合到标准结合等温线（线）（补充方程（2））。情节中心是均值；错误条代表1 S.D.来自三个独立重复 。拟合的KD值以95％的置信区间显示（实验误差的估计值） 。与C中一样，MSIRT1和MSIRT1被困ES在RISC内形成稳定的三元复合物的能力等效。模拟数据集（虚线）表示对应于KD值低十倍（红色）或比MSIRT1和MSIRT1捕获ES的平均值的曲线高十倍（绿色） ，这为我们实验误差的振幅提供了框架 。D ，顶部，北印迹显示了AGO2中加载的miR-34a的检测 。底部是标准校准曲线（使用裸miR-34a） ，用于在RISC中获得miR-34a的估计值。中心校准曲线用于计算R2 。两条外曲线表明校准线拟合的95％置信区间（来自单个重复实验） 。AGO2和miR-34a的平均比率（均为PMOLE）用于获得带有我们的指南的AGO2的分数（约为1.5％）。紫外线熔化 ，EMSA滴定，FBA滴定和Northern blot的完整列表在补充表1a – d中 。紫外线熔化 ，EMSA滴定和FBA滴定的完整拟合分析在补充表7-9中 。
本文来自作者[admin]投稿，不代表东辰文化立场，如若转载，请注明出处：http://www.mzwhys.cn/wiki/202506-1716.html
评论列表（4条）
我是东辰文化的签约作者“admin”！
希望本篇文章《碱基对构象开关调节miR-34a SIRT1 mRNA的靶向》能对你有所帮助！
本站[东辰文化]内容主要涵盖：生活百科,小常识,生活小窍门,知识分享
本文概览： a，此处使用的构造的单个A260紫外线熔融曲线。miR-34a – MSIRT1双链体，miR-34a – MSIRT1将ES双链体，miR-34a – complenta...