高通量测序项目生成物种级系统发育的基因组规模序列数据1,2,3。但是，推断时间表的最新贝叶斯方法在计算上仅限于小型数据集，并且无法利用可用基因组数量越来越大。就哺乳动物而言 ，对有限数据集的分子锁定分析产生了较大不确定性的进化枝年龄的相互估计5,6 ，因此胎盘哺乳动物进化的时间尺度仍然有争议7,8,9,10 。在这里，我们开发了一种贝叶斯分子锁定方法 ，以估计4,705种哺乳动物的时间表 ，该哺乳动物综合了72个哺乳动物基因组的信息 。我们表明，越来越大的系统基因组数据集会产生多样化的时间估计 ，并逐渐较小的不确定性 ，从而促进了宏观进化假设的精确检验。例如，我们自信地拒绝古元中的胎盘哺乳动物起源的爆炸性模型 ，并表明Crown胎盘起源于白垩纪晚期 ，在古代/始新世中具有明确的顺序多样性 。我们的贝叶斯方法促进了整体基因组和数千种物种在一个综合框架内的分析，从而有可能解决有关物种多样化的棘手的研究问题 。这种方法可用于解决其他有争议的动物和植物多样性案例 ，这些案例需要分析物种水平的系统基因组数据集。
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希望本篇文章《哺乳动物进化的物种水平的时间表整合系统基因组数据》能对你有所帮助！
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