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(a)在粪肠球菌或粪肠球菌Arcd :: Tn上清液中存在的艰难梭菌生长 。(平均值±S.D.,n = 8/组 ,双向方差分析,时间因子P <0.001)。(b)具有症状CDI的成年患者(n = 48)映射到ARC基因的读取的分类学分布(在细菌家族级别)。每列都是一个主题,每一行都是细菌家族 。每个细胞显示映射到所有ARC映射读数中特定家族的ARC基因的读取百分比。(c)每位成年患者中含有细菌家族的前10个电弧操纵子的相对丰度(症状都感染了艰难梭菌(n = 48 ,下部和上部铰链)对应于第一个(25%)和第三(75%)四分位数(75%)和下部四分位数。上和下晶须从铰链延伸至最大的值,不超过1.5*iqr。(d)在引入粪肠球菌的上清液以及通过ELISA测量的外源L-雌氨酸的上清液后产生艰难梭菌的毒素(平均值±S.D.,n = 3,Tukey的多重比较测试 ,艰难梭菌+/-鸟氨酸梭菌P = 0.705) 。(E)未感染或感染小鼠的MALDI-IMS图像(感染后3D)(SPF)(n = 5小鼠的代表)或(F)与艰难梭菌CD196单感染或与E. faecalis og1rf共同感染的GF小鼠(2D后接收后)(n = 4米)。精氨酸和鸟嘌呤的单个热图。(g)通过靶向代谢组学测量的粪便中的鸟氨酸水平仅感染了艰难梭菌(平均值±S.D.,n = 10)或艰难梭菌 + E. faecalis og1rf(平均值±s.d.,n = 3 ,n = 3,带有welch校正的两侧t检验,p <0.001) 。在感染之前对GF小鼠进行了代谢组学(GF组 ,n = 13)。(H)仅感染了艰难梭菌的GF小鼠的精氨酸水平(平均±S.D.,n = 10,带有Welch校正的双面t检验 ,p = 0.023)或艰难梭菌 + E. faecalis og1rf(平均值±S.D.。在感染之前进行的粪便代谢组学(GF组,n = 13) 。(i)在CDI期间,E. faecalis og1rf(野生型)或E. faecalis arcd :: Tn的CFU。在CDI之前引入的每种菌株 ,并与内源性肠球菌(n = 5/group)自然竞争(平均值±S.E.M.双侧Mann-Whitney测试,采用Bonferroni-Dunn方法进行多次比较,第2天P = 0.048,第3天 ,第3 p = 0.024)。(j)鸟氨酸(p = 0.014)和(k)精氨酸(p <0.001)在被艰难梭菌感染的GF小鼠中测得的粪便水平(p <0.001)水平 。与E. faecalis(n = 3)或E. faecalis arcd :: Tn(n = 4)(平均值±S.D.,带Welch校正的双面t检验)预殖了1天的小鼠。在感染之前对GF小鼠进行的代谢组学(GF组,n = 5)。
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